Les racines des arbres peuvent endommager les trottoirs, les canalisations et les installations humaines. Par conséquent, la reconstruction du système racinaire dans ses trois dimensions est d'une importance capitale pour comprendre et réduire les interactions entre les arbres et les infrastructures urbaines. Le radar à pénétration de sol (GPR) est une technique non invasive pour l'étude des racines des arbres. Dans cette contribution, des simulations GPR ont été réalisées sur des racines sous le logiciel GprMax en mode 3D sous des conditions de sol hétérogènes. Une chaîne de post-traitement des radargrammes a été développée pour reconstruire les architectures racinaires. Le traitement proposé est basé essentiellement sur la technique de décomposition en valeurs singulières (SVD) pour la réduction du bruit, la Transformée de Hough et la technique du filtre adapté.